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土壤中的超小型捕食者:类型和作用

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土壤中的超小型捕食者:类型和作用

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土壤中的超小型捕食者:类型和作用


土壤生物多样性

土壤不仅仅是由沙子、粘土和黄土组成的深色泥土,还具有高度的生物 多样性,生活着数以百万计的各种类型和大小的生物。土壤不仅比地球 上任何其他生态系统具有更多的生物多样性,而且所有土壤生物(包括 根部约占土壤生物一半的植物)的重量远远大于所有其他生物的重量总 和[1]。土壤生物大小不一,包括微小的病毒、可以蔓延几百米的巨大真 菌,以及介于这两者之间的一切!土壤中的微观生命被称为土壤微生物 组,主要由细菌和真菌组成。如果没有具有生物多样性的微生物组,土 壤将无法回收养分并促进植物生长。本文重点介绍原生动物和线虫这两 类很少有科学家研究的土壤生物。读完本篇文章后,希望大家能理解为 什么需要更多的研究来集中在这些微小的生物体上!

原生动物和线虫:微型捕食者

微生物组捕食者是以细菌和真菌等微生物为食的生物[2]。原生动物和线 虫是最重要的微生物组捕食者之一。线虫超级小,比人类头发的宽度还 要小100倍,所以肉眼无法观察到它们。科学家最熟悉的线虫是一种被称 为Caenorhabditis elegans的蛔虫,经常被用于研究中。许多科学家、医生、 农民和园丁都知道线虫是害虫,因为有些物种可以感染人类,有些则会 引起植物疾病。在土壤中,线虫捕食细菌、真菌或其他线虫,并可能成 为动物和植物的寄生虫。虽然大多数线虫看起来基本相同,但却有着数 十万个不同的物种(图1A)1。地球上10个动物中有8个是线虫,换句话

说,每一个人身上就有600亿条线虫[3]!

土壤中的原生动物比线虫多1000倍!原生动物是一种不能被归为动物或 植物的微生物,是真核生物,它们像动物、真菌和植物的细胞一样含有 细胞核。虽然 “原生生物 ”一词对你来说可能很陌生,但你应该听说过一 些著名的原生生物的例子:比如湖泊和海洋中进行光合作用的所有真核 藻类都是原生生物,导致疟疾的恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)也 是原生动物。除了变形虫(Amoebae)和草履虫(Paramecium),世界 上还有很多其他的原生动物! 地球上大部分真核生物的多样性可能是由有 着数百万种的原生生物组成的,但是我们对现有的原生生物物种的了解 还不到百分之一。在土壤中,原生动物有着广泛的功能。大多数原生动 物以细菌为食,但也有原生动物以真菌甚至较大的动物为食。一些原生 动物是植物和动物的寄生虫,而一些原生生物(如地衣)与真菌有密切 关系[4]。原生动物有超级多样且漂亮的形状(图1B)2。与狮子或其他大 型捕食者类似,微生物组捕食者也会捕食许多它们可以捕获的东西(图 1C,D);这样,这些微型捕食者可以控制微生物的生长,改变土壤生态 系统中的生物种类,并帮助土壤发挥其重要功能。对微生物组的捕食还 会导致营养物质释放到土壤中,从而被其他微生物和植物吸收,帮助其 生长。微生物组捕食者通常以不太活跃的微生物为食,从而使整个微生 物组呈现更加活跃的状态——这种捕食策略类似于狮子:通过捕食年龄较 大、速度较慢和较弱的个体来诱导猎物向更健康的状态发展。

我们应该如何研究微生物组捕食者?

由于线虫和原生动物很小,在土壤中是不可见的,所以科学家们不能在 其自然栖息地直接研究。用于研究这些生物的一个方法是将它们从土壤 中分离出来。这种方法对线虫来说比较容易,你甚至可以在家里使用咖

啡滤纸或纸巾、水和一个碗等工具进行尝试(图2)!3

研究原生动物则更为复杂。土壤中大多数的原生动物都强烈地附着在土 壤颗粒上,过去研究它们最好的方法是将少量的土壤与细菌放在一起, 然后提取以细菌为食的原生动物。然而,只有少数类型的原生动物可以 通过这种方式生长,因此许多原生动物物种仍然是未知的。今天,大多 数研究人员使用分子工具,如从土壤中提取的DNA来识别这些微型生物。 因为每个生物体都有独特的DNA序列,我们可以通过DNA测序技术,根据 其独特的DNA来区分各个物种。尽管我们用肉眼观察不到,也不能在实验 室里培养它们(图3),但这种方法可以告诉我们究竟存在哪些土壤生物。 这些提取、培养和测序的方法向我们展示了土壤样品中存在哪些物种, 但并没有展示这些物种的作用。有些方法可以了解土壤中原生动物和线 虫的功能,包括将捕食者与各种猎物微生物结合起来,观察它们是如何 相互作用的;还有一些科学方法可以通过[5]中所述的特殊方法追踪某些 土壤化合物,从而揭示土壤中的生物以什么为食。

我们为什么要关心微生物组捕食者?

如果没有微生物组捕食者,土壤会出现大问题,这会给人类带来麻烦! 几乎所有进入土壤的营养物质都被细菌和真菌吸收了,所以如果不加以 控制,那么数量最多的细菌就会吸收并长期保留所有的营养物质。土壤 中的微生物在没有捕食者的情况下可以存活数月,甚至可以进入长期生 存阶段(可存活数十年)。这样会使得食物链终止,导致更大的生物无 法生存。植物从土壤中吸收的养分也会少得多,从而生长缓慢。但通过 捕食微生物并释放营养物质,微生物组捕食者可以确保植物能够获得营 养物质;并且微生物组捕食者本身也可以作为较大生物的猎物。因此, 微生物组捕食者通过帮助土壤发挥其关键功能,最终拯救了我们的食物 供应。 片

结论

原生动物和线虫是地球上生物多样性最丰富、数量最多的生物之一;也 是重要的微生物组捕食者,在确保土壤正常运作方面发挥重要作用。如 果没有微生物组捕食者,地下和地上的生命就不可能存在!微生物组捕 食者对植物生长至关重要,而且在其他微生物过程中也发挥着关键作用。 通过对微生物组原生动物和线虫的了解,我们也将对土壤的工作方式有 更好的理解。如果清楚如何调整土壤中微生物组捕食者的类型和数量, 就可以帮助保持土壤微生物组的健康并保护土壤功能。微生物组捕食者 在土壤中的关键作用清楚地表明,我们不应该忘记地球上的任何生命群 体,因为即使是最小的生物体也会有独特的功能重要性,这有助于维持 包括人类在内的许多其他生物的生存。

Figures

Figure 1: An impression of how nematodes (A) and protists (B) look like under the microscope. Figure 1: 显微镜下的线虫(A)和 原生动物(B)。与草原 生态系统中著名的捕食 者狮子(C)类似,微生 物组捕食者(D)在地下 生态系统中也发挥着类 似的重要作用。原生动 物和线虫以细菌和真菌 为食,改变了土壤生物 的组成和活动,有助于 保持土壤的健康。图片 来源。A:线虫 (Anaplectus porosus和 Aphelenchoides)来自 Hanny van Megen); B:原生动物 (Hyalosphenia papilio、 Heliamoeba sp和 Mayorella viridis)来自 www.penard.de,获得 Eckhard Völcker和Steffen Clauß许可;C:狮子和 斑马图片来自 https://purepng.com/ (获得CCO许可)。D: 细菌漫画,来自维基百 科,获得CC0许可。 DNA测序 一种确定生物体DNA序 列的方法,可用于识别 生物体。

Figure 2: Nematode extraction at home. Figure 2: 在家提取线虫。如图所 示:将一把土壤放在两 个咖啡滤纸上,用衣夹 封住,然后将滤纸放在 一个装满水的碗里(水 应覆盖住滤纸中的土 壤)。第二天,取出咖 啡滤纸,混合溶液并将 其转移到一个薄玻璃杯 中,等待一小时,然后 小心地倒掉大部分液 体,只留下一点在玻璃 杯底部。现在你就可以 用放大镜或显微镜观察 剩余溶液中的线虫了。

Figure 3: In addition to being well hidden in the soil, microbiome predators are too small to be seen by the naked eye. Figure 3: 除了在土壤中隐藏得很 好之外,微生物组捕食 者也太小了,所以肉眼 无法看到。为了研究这 些生物,科学家们通常 通过从土壤中提取DNA 并对该DNA进行测序来 确定所有存在的原生动 物和线虫的种类。 (图片 来源: https://www.bioanaly sis-zone.com/,版权 免费(CC0)。 Geisen EDITED BY: Rémy Beugnon, German Centre for Integrative Biodiversity Research (iDiv), Germany CITATION: Geisen S (2021) Super-Small Predators in Soils: Who Are They and What Do They Do? Front. Young Minds 9:597620. doi: 10.3389/frym.2021.597620